PKBWL współpracuje z następującymi organizacjami krajowymi w ramach zawartych porozumień:
Przedsiębiorstwo Produkcyjne
Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji
Instytut Techniczny Wojsk Lotniczych
Polska Agencja Żeglugi Powietrznej
Urząd Lotnictwa Cywilnego
Wojskowy Instytut Medycyny Lotniczej
Wydział Mechaniczny Energetyki i Lotnictwa Politechniki Warszawskiej
PKBWL jest także aktywnym członkiem organizacji międzynarodowych zrzeszających organy i specjalistów ds. badania wypadków lotniczych takich jak:
European Network of Civil Aviation Safety Investigation Authorities
European Civil Aviation Conference (Europejska Konferencja Lotnictwa Cywilnego)
European Society of Air Safety Investigators
International Society of Air Safety Investigators
PKBWL współpracuje także z następującymi zagranicznymi organami ds. badania zdarzeń lotniczych w ramach zawartych porozumień:
Bureau d’Enquêtes et d’Analyses pour la sécurité de l’aviation civile
Bundesstelle für Flugunfalluntersuchun
